MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021881	TTC	2	6	1434366	1434371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_021881	T	6	6	1434435	1434440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_021881	ATAC	2	8	1434441	1434448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8504	NC_021881	CTT	2	6	1434535	1434540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_021881	TAA	2	6	1434589	1434594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_021881	AT	3	6	1434642	1434647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_021881	GAT	2	6	1434663	1434668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021881	GATA	2	8	1434677	1434684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_021881	ATTT	2	8	1434702	1434709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021881	TTGA	2	8	1434710	1434717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021881	TAT	2	6	1434750	1434755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021881	ATT	2	6	1434778	1434783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021881	ATT	2	6	1434792	1434797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_021881	T	6	6	1435010	1435015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_021881	AT	3	6	1435031	1435036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_021881	ATA	2	6	1435043	1435048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021881	AT	3	6	1435052	1435057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_021881	TAA	2	6	1435084	1435089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021881	TTAT	2	8	1435128	1435135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_021881	ATTG	2	8	1435186	1435193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_021881	AG	3	6	1435803	1435808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021881	AGA	2	6	1435867	1435872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021881	AGT	2	6	1435932	1435937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_021881	CG	3	6	1435988	1435993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8525	NC_021881	ATC	2	6	1436255	1436260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_021881	CAA	2	6	1436319	1436324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_021881	ATAG	2	8	1436353	1436360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_021881	TAT	2	6	1436384	1436389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_021881	TTG	2	6	1436400	1436405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_021881	AAC	2	6	1436429	1436434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_021881	ACC	2	6	1437351	1437356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_021881	TGA	2	6	1437407	1437412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_021881	CTC	2	6	1437421	1437426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8534	NC_021881	AAT	2	6	1437479	1437484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_021881	TGC	2	6	1437551	1437556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_021881	TCTT	2	8	1438951	1438958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8537	NC_021881	GTA	3	9	1439027	1439035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_021881	TG	3	6	1439364	1439369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_021881	TGC	2	6	1439378	1439383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_021881	GCA	2	6	1439411	1439416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_021881	T	6	6	1439417	1439422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_021881	TTTCT	2	10	1439425	1439434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8543	NC_021881	TC	3	6	1439531	1439536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8544	NC_021881	GTG	2	6	1439550	1439555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_021881	GA	3	6	1439558	1439563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021881	GTG	2	6	1439604	1439609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_021881	TGC	3	9	1439669	1439677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_021881	GT	3	6	1439785	1439790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_021881	TCT	2	6	1439826	1439831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_021881	CA	4	8	1439890	1439897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8551	NC_021881	TTA	2	6	1440028	1440033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_021881	TATG	2	8	1440064	1440071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_021881	CTA	3	9	1440084	1440092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_021881	CA	4	8	1440146	1440153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8555	NC_021881	GGT	2	6	1440171	1440176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_021881	TTA	2	6	1440285	1440290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021881	TATG	2	8	1440321	1440328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_021881	CTA	3	9	1440341	1440349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_021881	ACA	2	6	1440399	1440404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_021881	TTA	2	6	1440535	1440540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_021881	TATGTA	2	12	1440571	1440582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021881	GGT	2	6	1440678	1440683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_021881	TAC	3	9	1440686	1440694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_021881	T	7	7	1440817	1440823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021881	AGT	2	6	1440890	1440895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_021881	ACC	2	6	1440967	1440972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8567	NC_021881	TGA	2	6	1441021	1441026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_021881	CTC	2	6	1441035	1441040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_021881	AAT	2	6	1441093	1441098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_021881	ATT	2	6	1441146	1441151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_021881	GTA	2	6	1441529	1441534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_021881	ATT	2	6	1441554	1441559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_021881	TA	3	6	1441608	1441613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_021881	GAAT	2	8	1441663	1441670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_021881	AAG	2	6	1441716	1441721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_021881	CTTA	2	8	1441722	1441729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8577	NC_021881	CGT	2	6	1441735	1441740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8578	NC_021881	ACA	2	6	1441772	1441777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_021881	CAC	2	6	1442088	1442093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8580	NC_021881	TAGTAT	2	12	1442098	1442109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_021881	GCG	2	6	1442159	1442164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_021881	CTA	2	6	1442171	1442176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_021881	CT	3	6	1442178	1442183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8584	NC_021881	A	7	7	1442208	1442214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_021881	AAT	2	6	1442230	1442235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_021881	TTG	2	6	1443133	1443138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_021881	TTG	2	6	1444723	1444728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_021881	ATT	2	6	1444755	1444760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_021881	TAA	2	6	1444768	1444773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_021881	GCA	2	6	1444788	1444793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_021881	ATTAT	2	10	1445769	1445778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_021881	AGTAT	2	10	1445783	1445792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_021881	GGT	2	6	1445800	1445805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_021881	CAT	2	6	1445813	1445818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_021881	AAG	2	6	1445859	1445864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_021881	AAT	2	6	1445889	1445894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_021881	TCT	2	6	1445924	1445929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_021881	CTAT	2	8	1446207	1446214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8599	NC_021881	TG	4	8	1446223	1446230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_021881	GCA	2	6	1446251	1446256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_021881	AGAGG	2	10	1446286	1446295	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_021881	AG	3	6	1446321	1446326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_021881	ACG	2	6	1446344	1446349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_021881	GAG	2	6	1446362	1446367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_021881	AC	3	6	1446390	1446395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8606	NC_021881	TA	3	6	1447007	1447012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_021881	AAAT	2	8	1447033	1447040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_021881	CTA	2	6	1447079	1447084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_021881	TG	3	6	1447660	1447665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_021881	TAA	2	6	1447701	1447706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_021881	CTA	2	6	1447770	1447775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_021881	TGT	2	6	1447788	1447793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_021881	CTA	2	6	1448420	1448425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_021881	TTAA	2	8	1448984	1448991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_021881	ACC	2	6	1449685	1449690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8616	NC_021881	GAAA	2	8	1449698	1449705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_021881	GC	3	6	1449745	1449750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8618	NC_021881	TAA	2	6	1450246	1450251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_021881	TTA	2	6	1450371	1450376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_021881	CT	3	6	1450397	1450402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8621	NC_021881	A	8	8	1450407	1450414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_021881	TGCGAA	2	12	1450423	1450434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8623	NC_021881	TAG	2	6	1450517	1450522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_021881	TTC	2	6	1450542	1450547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_021881	ATC	2	6	1450559	1450564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_021881	GTT	2	6	1450603	1450608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_021881	TGTA	2	8	1450624	1450631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_021881	ATC	2	6	1450646	1450651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_021881	AGG	2	6	1450708	1450713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_021881	TTC	2	6	1452533	1452538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8764	NC_021881	TAA	2	6	1472160	1472165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8765	NC_021881	CAT	2	6	1472191	1472196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8766	NC_021881	ACA	2	6	1472214	1472219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8767	NC_021881	TA	3	6	1472267	1472272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8768	NC_021881	A	7	7	1472320	1472326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8769	NC_021881	TTGTA	2	10	1472391	1472400	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8770	NC_021881	ATA	2	6	1472426	1472431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8771	NC_021881	GCA	2	6	1472432	1472437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8772	NC_021881	A	6	6	1472460	1472465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8773	NC_021881	CAC	2	6	1472474	1472479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8774	NC_021881	GAA	2	6	1472527	1472532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8777	NC_021881	AGC	2	6	1472585	1472590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8781	NC_021881	GT	5	10	1472747	1472756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8782	NC_021881	AACT	3	12	1473242	1473253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8783	NC_021881	TTA	3	9	1473279	1473287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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